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以決鬥守護新童實野市的不動遊星,被為了毀滅世界從未來而來的神秘男子・帕拉杜克斯將自己的王牌怪獸星塵龍奪走。 接著遊星進行時間旅行,來到能使用卡片精靈之力的遊城十代的所在。遊星在這裡得知事件的真相。那個真相究竟是? 為了追趕帕拉杜克斯,來到傳說的決鬥者・武藤遊戲時代的遊星,跟十代與遊戲相遇,誓言合力一戰。為了拯救世界,也為了奪回遊星的星塵龍,遊戲・十代・遊星和帕拉杜克斯展開壯烈的決鬥!